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PCR技術(shù)服務(wù)

PCR技術(shù)服務(wù)

產(chǎn)品時間:2023-01-23

簡要描述:

南京信帆生物技術(shù)有限公司提供實驗室代測服務(wù),包括放免實驗代做,免疫組化,PCR,WB實驗代測等到,精準的設(shè)備加上技術(shù)嫻熟的實驗操作人員,讓您的每一份實驗結(jié)果均真實可靠,咨詢!PCR技術(shù)服務(wù),Q-,RT-PCR實驗代做本產(chǎn)品僅供科研,不得用于臨床,醫(yī)療,食用等

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PCR技術(shù)服務(wù),Q-PCR技術(shù)服務(wù),RT-PCR實驗代做

南京信帆生物提供 PCR實驗代測,實時熒光定量PCR實驗代測,RT-PCR代測。客戶只需要提供樣本,其他所有試劑都由本公司提供。一般7-10天出結(jié)果,提供原始數(shù)據(jù),分析數(shù)據(jù),實驗報告,實驗室所用儀器型號,圖片,動力擴增曲線等。代測費用原價150元,現(xiàn)在6.2折*,!
 
Real -Time PCR,即實時監(jiān)測PCR擴增產(chǎn)物并進行解析的方法,它是在PCR反應(yīng)體系中加入熒光物質(zhì),并通過Real -Time PCR檢測系統(tǒng)對PCR反應(yīng)進程中的熒光信號強度進行實時監(jiān)測,zui終對實驗數(shù)據(jù)進行分析處理的方法。Real -Time PCR自1996年由美國Applied Biosystems公司推出以來,廣泛應(yīng)用于生物研究的各個領(lǐng)域。目前主要有SYBR Green 染料、Taqman探針法兩種。
 
PCR實驗代測,熒光定量PCR代測服主要儀器及耗材
旋渦振蕩器 :上海青浦瀘西儀器廠產(chǎn)品
手握式電動勻漿機:德國FLUKO 公司產(chǎn)品
低溫冷凍離心機:Sigma(3K15)公司產(chǎn)品
Real-time檢測儀:ABI (ABI-7300)公司產(chǎn)品
超純水分離系統(tǒng):美國LABCONCO公司
離心管及10μL、200μL、1000μL槍頭等常規(guī)耗材均為國產(chǎn);RNA提取過程中所需的離心管、槍頭等耗材經(jīng)過0.1%的DEPC水浸泡過夜,121℃滅菌30min,烘干后備用。
 
PCR實驗代測,熒光定量PCR代測服實驗室試劑的操作
1)所用的所有溶液都應(yīng)該沒有核酸和(或)核酸酶(DNase和RNase)污染。
2)所有PCR試劑中使用的水都應(yīng)該是高質(zhì)量的-新鮮蒸餾的去離子水,用0.22μm過濾的,并且是高壓滅菌。
3)在20℃到25℃貯存的試劑建議加點像疊氮鈉一類的抗微生物劑,在擴增試劑或樣品制備試劑中加入0.025%的疊氮鈉不抑制擴增反應(yīng)。
4)所用試劑都應(yīng)該以大體積配制,實驗一下看試劑是否滿意,然后分裝成僅夠一次使用的量進行貯存。
5)所有試劑和樣品準備過程中都要使用一次性滅菌的瓶子和管子。
6)新配制的試劑在用于準備新的標本之前應(yīng)該加以檢驗。
7)樣品準備和前PCR區(qū)所使用的移液管在不使用時都應(yīng)該小心保存。


本程序適用于自動PCR操作,可適用于大多數(shù)情況,所用酶是不含核酸外切酶活性的熱穩(wěn)定聚合酶,如Taq聚合酶等。 
引物(各50pmol) 0.2mmol/L dNTPs(必須使用高質(zhì)量的dNTPs,這一點非常重要。dNTPs經(jīng)反復(fù)化凍后會發(fā)生降解,因此應(yīng)分成小份保存。應(yīng)注意混合物中四種dNTP的量要相等) 模板DNA:約0.05~1mg基因組DNA或0.002~0.02mg質(zhì)粒DNA Taq DNA聚合酶(Perkin Elmer, Norwalk, Connecticut) 10×PCR緩沖液(500mmol/L KCl,15mmol /L MgCl2,100mmol/L Tris·HCl,pH 8.3) 礦物油 
電泳所需試劑 
【儀器設(shè)備】 
PCR擴增儀 
電泳裝置 
微量離心機 
微量移液器(1~20ml和20~200ml) 
0.5ml Eppendorf 管 
紫外線觀察裝置及照相設(shè)備

 操作程序 

1.在無菌的Eppendorf管內(nèi)加入以下反應(yīng)物:

2.93℃ 反應(yīng)2 min后開始以下循環(huán): 
93℃變性反應(yīng)1 min; 
50℃退火反應(yīng)1 min; 
72℃延伸反應(yīng)3 min。 
經(jīng)過17~35循環(huán)后,zui后一個循環(huán)72℃增加5 min。循環(huán)結(jié)束后反應(yīng)產(chǎn)物置于40℃保存。 
3.取1~5ml反應(yīng)產(chǎn)物走凝膠電泳,經(jīng)溴化乙錠染色檢測擴增的情況。


,Q-,RT-PCR實驗代做


應(yīng)注意的問題及其解決方法 

1.PCR反應(yīng)條件的優(yōu)化 
要優(yōu)化特定的PCR反應(yīng),有必要試用不同的反應(yīng)組分和循環(huán)參數(shù)。表2-1列出了添加或改變某一試劑濃度對反應(yīng)結(jié)果的影響,從中大家可以得到一些線索以改進反應(yīng)條件,提高PCR產(chǎn)量和/或特異性,一般情況下,只須改變一兩個參數(shù)就行了,如pH值和MgCl2濃度。表2-2給出了循環(huán)參數(shù)對PCR結(jié)果的影響。 
表2-1 PCR各反應(yīng)組分濃度對產(chǎn)物特異性和產(chǎn)量的影響

反應(yīng)組分提高產(chǎn)量提高特異性
模板濃度增加減少
引物濃度高至75 pmol低至15 pmol
引物長度增加
dNTPs各1 mmol/L各20 mmol/L
Tris-HCl (10 mmol/L pH8)pH高至10*pH高至10*
MgCl2高至4 mmol/L1.5 mmol/L
DMSO10%**
甘油2%
甲酰胺5%
Taq DNA聚合酶***高至5U0.5U


* 效果可能不可預(yù)測
** 添加10% DMSO時,Taq DNA聚合酶的活性會被抑制47%,因此反應(yīng)加大Taq DNA聚合酶的用量(即5U)予以補償
*** Perkin Elmer, Norwalk, Connecticut
表2-2 可改變以提高PCR產(chǎn)物的特異性和/或產(chǎn)量的循環(huán)參數(shù)

反應(yīng)條件提高產(chǎn)量提高特異性
循環(huán)數(shù)zui多35個減至25個
變性*增至1 min
引物退火**降至45℃升至72℃
引物延伸***在后期循環(huán)中延長維持30s


* 使用基因組DNA作模板時,開始幾個循環(huán)變性應(yīng)于97℃進行 
** 假定Tm值為60℃ 
*** 延伸時間依產(chǎn)物大小而定:1000bp的產(chǎn)物延伸30s即可,產(chǎn)物更長時,按每1000 bp延伸0.5 min計,在后期循環(huán)中增加延伸時間可以提高擴增效率
2.引物的設(shè)計 
毫無疑問,引物的堿基組成,長度及其靶序列的同源性是決定PCR成敗的首要因素,選擇設(shè)計引物在一定程度上仍然要靠經(jīng)驗,對于某一對引物而言尚無通用的規(guī)則可嚴,但應(yīng)遵守以下原則: 
(1)一般性原則: 
①長度:15~30bp,其有效長度 [Ln=2 (G+C)+(A+T)] 一般不大于38,否則PCR的zui適延伸溫度會超過Taq酶的作用溫度(74℃),從而降低產(chǎn)物的特異性。 
②G+C含量:應(yīng)在45%~55%之間,PCR擴增中的復(fù)性溫度一般是較低Tm值引物的Tm值減去5~10度。引物長度小于20時,其Tm值等于4×(G+C)+2×(A+T)。 
③ 堿基分布的隨機性:應(yīng)避免連續(xù)出現(xiàn)4個以上的單一堿基。尤其是不應(yīng)在其3’端出現(xiàn)3個的連續(xù)的G或C,否則會使引物在G+C富集序列區(qū)錯誤引發(fā)。 
④ 引物自身:不能含有自身互補序列,否則會形成發(fā)夾樣二級結(jié)構(gòu)。 
⑤引物之間:兩個引物之間不應(yīng)有多于4個的互補或同源堿基,不然會形成引物二聚體,尤應(yīng)避免3’端的互補重疊。 
⑥特異性:與非特異擴增序列的同源性應(yīng)小于70%,或少于連續(xù)8個的互補堿基。 
(2)引物的3’端: 
引物的3’端很大程度上影響Taq酶的延伸效應(yīng),除特殊情況(AS-PCR)外,3’端不應(yīng)發(fā)生錯配。S. Kwok等發(fā)現(xiàn),引物的3’端發(fā)生錯配時,A:A使產(chǎn)量下降至1/20,A:G或C:C下降至1/100。當(dāng)末位堿基是T時,即使錯配也能引發(fā)鏈的合成,而為A時錯配的引發(fā)效率zui低,G、C居間。 
因此,引物的3’端堿基選用A、G、C,而盡可能地避免選用T,尤應(yīng)避免連續(xù)出現(xiàn)2個以上的T。 
此外,如果擴增編碼區(qū)域,引物的3’端不要終止于密碼子的第3位,因此處易發(fā)生簡并,從而影響擴增特異性。 
(3)避開引物的二級結(jié)構(gòu)區(qū): 
某些引物無效的原因是引物重復(fù)區(qū)二級結(jié)構(gòu)的影響,因此選擇擴增片段時應(yīng)注意避開二級結(jié)構(gòu)區(qū),有些計算機軟件可幫助確定該區(qū)域,如不能避開,則可用7- deaza-2’-脫氧GTP取代dGTP,有助于PCR成功。 
目前在引物選擇中已廣泛應(yīng)用計算機軟件,從EMBL或Genebank中查找有關(guān)基因序列,并依據(jù)上述原則對所選用引物進行評價。 
3.出現(xiàn)異常結(jié)果時的解決思路 
在做PCR反應(yīng)的過程中,由于其酶促反應(yīng)的本質(zhì),影響zui終結(jié)果的因素較多,所以出現(xiàn)一些非預(yù)料的結(jié)果是可以理解的。下面簡單地總結(jié)一下在PCR反應(yīng)結(jié)果出現(xiàn)異常時我們應(yīng)該采取的措施。 
(1)電泳檢查沒有 PCR產(chǎn)物 
a.需檢查一下Taq DNA聚合酶是否失活,或是活性太低,還需查一下在加樣過程中是否向體系中加過Taq DNA聚合酶; 
b.需檢查一下所使用的引物,看其序列設(shè)計是否正確,是否堿基組成不平衡; 
c.需要檢查一下PCR反應(yīng)過程中模板是否變性充分,尤其在前幾個循環(huán)中是否變性充分;可以適當(dāng)?shù)靥岣吣0遄冃缘臏囟然蚴沁m當(dāng)延長變性的時間;  
d.需檢查一下在PCR反應(yīng)體系中是否有Taq DNA聚合酶的抑制劑,如SDS污染等等; 
e.需檢查一下模板中是否有蛋白酶和核酸酶的污染,可以預(yù)先加熱使之失活。 
(2)電泳檢查出現(xiàn)引物二聚體區(qū)帶 
a.需檢查一下兩個引物的3’端是否互補,或者是否有相類似的回文結(jié)構(gòu); 
b.需檢查一下使用的引物是否太短,可以予以適當(dāng)?shù)难娱L; 
c.需檢查模板的用量,模板以10-4個拷貝,模板太少會造成引物相對過量; 
d.適當(dāng)?shù)亟档鸵锏臐舛?,引物濃度過高是出現(xiàn)引物二聚體的zui主要原因;  
e.循環(huán)次數(shù)太多也易形成引物二聚體,可以適當(dāng)?shù)販p少循環(huán)數(shù);  
f.可以將復(fù)性溫度提高一些以減少引物二聚體形成。  
(3)電泳檢測PCR產(chǎn)物呈片狀(smear)  
a.需檢查一下Taq DNA聚合酶的用量,適當(dāng)?shù)販p少Taq酶的量有助于特異性條帶擴增;  
b.可以提高反應(yīng)的退火溫度,或者直接采用兩個溫度的PCR(68℃退火和延伸,94℃模板變性);  
c.適當(dāng)?shù)亟档蚆g 2+ 的濃度也可起到降低非特異性擴增可能性的作用;  
d.適當(dāng)?shù)販p少反應(yīng)退火的時間和延伸的時間;  
e.適當(dāng)?shù)販p少循環(huán)次數(shù)也會有效果;  
f.可以嘗試使用巢式引物PCR(nested primer PCR)。  
(4)電泳檢測PCR產(chǎn)物出現(xiàn)其它非特異性條帶  
a.需檢查一下引物的3’端是否有連續(xù)排列的G或C;  
b.可以適當(dāng)?shù)靥岣咄嘶饻囟然蛑苯硬捎脙刹綔囟萈CR方法進行擴增;  
c.可以降低Taq DNA聚合酶的用量,同時也降低引物的濃度;  
d.可以適當(dāng)?shù)販p少退火所用的時間以及延伸反應(yīng)的時間;  
e.可以適當(dāng)?shù)卦黾踊驕p少一些Mg 2+ 濃度。  
4.假陽性  
實驗中設(shè)立的陰性對照可提示有無假陽性結(jié)果出現(xiàn)。如果一次實驗中的幾個陰性對照中出現(xiàn)一個或幾個陽性結(jié)果,提示本次實驗中其它標本的檢測結(jié)果可能有假陽性。造成假陽性的原因包括樣品污染、擴增試劑污染、擴增產(chǎn)物交叉污染等。常見的污染來源包括實驗室環(huán)境、加樣器、操作中形成的噴霧、DNA抽提儀器、試劑及任何與擴增產(chǎn)物接觸的東西。  
預(yù)防各種污染的措施主要有:(1)工作區(qū)隔離。(2)改進實驗操作,如在加樣過程中避免試劑飛濺、吸頭離心管使用前高壓處理、試劑分裝成小份一次使用后棄去等。(3)操作程序合理化,如后加陽性對照等。  
交叉污染的處理方法包括:(1)在DNA模板和多聚酶加入前,紫外線照射反應(yīng)管內(nèi)容物以破壞污染的PCR產(chǎn)物。一般選用波長254nm照射30min(Nature, 1990, 34:27)。(2)PCR實驗中使用dUTP,而不用dTTP。在擴增前使用UraciⅠN-glycosylase(糖基化酶)處理可降解交叉污染的PCR產(chǎn)物,而不降解基因組DNA模板,然后熱滅活此酶,再進行擴增反應(yīng)(Gene, 1990, 93: 125)。美國PE公司提供此類試劑盒(PCR carry-over preventionkit)。(3)在PCR反應(yīng)前加入一種光化學(xué)試劑,反應(yīng)完成后激活該試劑,光化學(xué)試劑可交聯(lián) DNA鏈,使之不能再擴增(Nucleic Acids Res, 1991, 19: 99)。  
2.2.2.5 PCR技術(shù)在分子生藥學(xué)中的應(yīng)用  
對于生藥學(xué)家來說,PCR技術(shù)已稱為他們研究生藥的一種嶄新而有力的工具。PCR技術(shù)在生藥學(xué)中的應(yīng)用主要有兩方面:①擴增和直接測序或者對屬性特異的DNA序列定性以用于系統(tǒng)發(fā)育或親緣關(guān)系的分析,也可用于鑒定品種;②通過簡單純化從復(fù)雜生物樣品的混合物中鑒定病原體和土壤微生物,用于藥用植物的基因工程。


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